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用 GraphPad 作出优秀的药物抑制拟合曲线后,导师再也不嫌弃我的结果图了!

刚上研究生那会儿,每次组会,导师都会对我作的图嗤之以鼻,嫌弃一番。为此,我特地学习了一下如何作图,今天将这些花式作图技巧总结一下,希望对你有所帮助。 下面以药理学中经常用到的药物剂…

刚上研究生那会儿,每次组会,导师都会对我作的图嗤之以鼻,嫌弃一番。为此,我特地学习了一下如何作图,今天将这些花式作图技巧总结一下,希望对你有所帮助。


下面以药理学中经常用到的药物剂量依赖的抑制拟合曲线图为例给大家做讲解,作图软件是 GraphPad Prism6,使用 GraphPad Prism 作药物抑制拟合曲线图不仅图片优美,而且可以计算药物的半抑制浓度 IC50。



具体操作步骤:


1.打开 GraphPad Prism6,选择 XY 类型图,并对图示位置进行修改。




2.创建新的 file 后,在对应位置输入自己试验测定的结果。



3.将 x 轴的值进行转化,使之变为 Log[x]。点击 Analyze 后,选择 Transform。



4.双击 Transform,将 X 轴数据转变为 Log[x]。



5.点击 OK 后,可以看到 X 轴的数值全部变成了 Log 值。



6.选择拟合非线性回归曲线。



7.点击进入后,在 inhibition 一栏中找到 variable slope 一项。



8.选择该项,点击 OK 后,会自动生成拟合曲线,此时我们可以看到该药物的 IC50 为 6.406。



9.点击 Graphs 栏目下的 Transform ofDate1 后,可以看到拟合的抑制梯度曲线。



10.曲线拟合后,可以对自己的曲线图进行修改字体和大小。我按照一般杂志社要求给大家说说:字体大小一般为 9 号;字体类型为一般为 Arial。


为了视觉的美观,一般按照黄金分割值 0.618 对 X 和 Y 轴长度进行调整,习惯上用 3/5,图示中每个方格 1cm,所以将 Y 轴压缩至三格,X 轴压缩至五格。随后再加上 IC50 值,作出下图。



11.但是可以看到,曲线粗细不太协调,bar 也不太清晰,怎么处理呢?双击曲线,进入 Format 界面,对图示位置进行修改。



12.曲线修改后,接下来对 bar 进行微调,双击曲线中的任意一个节点,同样进入 Format 界面,对图示位置进行修改。



13.点击 OK 后,获得拟合曲线图,随后点击图示标志即可导入 ppt 中。



当然,有些同学可能不需要做抑制拟合曲线,但是这些技巧同样有用,特别是步骤 10 到步骤 13,这些都是讲作图时需要注意的细节。

只要做好每一个细节,相信你的图将会非常优美,快去试试吧~

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识别下图,在「丁香学术」公众号回复「1218」即可直接获得下载连接。步骤如下:



封面来源:站酷海洛 Plus

图片来源:作者提供

本篇文章来源于微信公众号: 生物学霸

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